SeqOne Genomics, choisie par les consortia FrOG et AURAGEN

SeqOne, qui œuvre pour la médecine personnalisée dans les domaines du cancer, des maladies rares et héréditaires, a annoncé jeudi 3 février 2022 deux partenariats majeurs.

Une nouvelle base de données génétiques…

Le premier partenariat industriel est avec le consortium FrOG (pour French OncoGenetics). Ce dernier vise à développer une base de données de variants [génétiques, ndlr] issus du séquençage de patients présentant une possible prédisposition aux cancers. Ce consortium réunit Centres de lutte contre le cancer, CHUs et Unicancer. La base de données, nationale et intitulée FrOG DB, se destine à faciliter le partage de connaissances concernant les gènes identifiés chez les patients au cours de diagnostic moléculaire. Ainsi qu’à centraliser en continu et de manière sécurisée les mutations pour les mettre à disposition de la communauté oncologique. D’après le communiqué, l’outil FrOG DB intègre actuellement environ 12 000 variants identifiés ces dernières décennies chez plus de 41 000 patients. Associé au système d’exploitation génomique propriétaire de la société -GeniOS-, cette base permettra d’harmoniser l’interprétation des données afin de guider plus précisément les services d’oncogénétique.

…et un outil pour les interpréter

Le deuxième partenariat annoncé par la DeepTech a été noué avec AURAGEN, consortium et constituant un des deux centres pilotes mandatés par le Ministère des Solidarités et de la Santé dans le cadre du Plan France Médecine Génomique 2025. La plateforme de séquençage à très haut débit, portant le même nom que le consortium, s’appuiera sur les solutions de SeqOne basées sur le Cloud qui sont (déjà) utilisées en routine clinique pour la la gestion de l’intégralité du processus d’analyse génomique, à partir des données brutes jusqu’au rapport final. Dans ce cadre, SeqOne permet de faciliter l’exploitation et l’interprétation des données de séquençage produites, ce qui permet d’accélérer le diagnostic, améliorer la prévention et le traitement des cancers et maladies rares.