L’Institut Curie ouvre l’accès à une nouvelle base de données

Lors du congrès de l’American Association for Cancer Research (AACR) qui se tient du 8 au 13 avril à la Nouvelle-Orléans, l’Institut Curie a présenté une nouvelle base de données permettant diverses applications en immuno-oncologie et analyse bio-informatique. Un “atlas” de jeux de données de séquençage en cellule unique de tous types de cancers a été créé et mis à disposition de la communauté scientifique. Ces données sont “très précieuses, coûteuses et systématiquement rendues publiques. En revanche, leur analyse est complexe et il est difficile de retrouver des jeux de données d’intérêt en cancérologie dans l’ensemble de la littérature”, détaille le communiqué. “L’atlas est homogène, intégré et annoté avec les connaissances les plus à jour. Sans aucune connaissance en bio-informatique, chacun peut accéder à ces données complexes et observer aisément l’expression des gènes dans tous les types et états cellulaires infiltrant les tumeurs”, a déclaré le Dr Caroline Hoffmann, chercheuse de l’Institut.

À noter : En février dernier, SeqOne a été choisie par deux consortia pour interpréter des données de séquençage.