Les initiatives françaises pour améliorer l’interopérabilité des données de santé

L’Agence du numérique en santé (ANS), en tant que régulateur et opérateur, intervient sur de multiples facettes de l’interopérabilité. Notamment la problématique majeure des terminologies standard et de leurs correspondances, dont le nombre ne cesse de croître. De même que l’hétérogénéité de leurs formats, canaux de publication et support. Dans ce contexte, l’ANS a mis en place un serveur multi-terminologies (SMT) visant à garantir un service unifié, public et gratuit de publication des terminologies utilisées en France. Les enjeux sont multiples : standardisation et diffusion de ces dernières, centralisation de leur hébergement et amélioration des processus de leur gestion.

L’exemple du référentiel d’interopérabilité du médicament

Actuellement, il n’existe pas de référentiel unique qui permettrait de répondre aux besoins de l’ensemble des acteurs concernés par la dématérialisation des prescriptions ou des dispensations médicamenteuses pour les patients, par exemple. Dans le cadre du Ségur, l’ANS mène des travaux à ce sujet. “L’interopérabilité peut faciliter la recherche en fournissant des terminologies. Les données médicamenteuses sont largement utilisées au sein de la chaîne de santé, notamment pour favoriser la coordination entre professionnels, pour la conciliation des médicaments ou la recommandation d’antibiotiques en fonction du contexte”, a décrit Mélissa Mary. Ces données se retrouvent dans de nombreux documents présentant chacun sa spécificité pour parler de soin : produits commercialisables, unités coûteuses en principe actif, etc. Elles sont tout aussi “exploitables” que les données cliniques qui aident à la recherche pharmaceutique . Mais à condition de répondre à certaines normes…

D’après l’experte interopérabilité & gestion de données, “en France, peu de normes sont actuellement utilisées pour parler des médicaments. Mais elles sont entretenues et organisées par des ressources différentes (MedicaBase, ANSM, HAS etc.), ce qui pose trois défis :

• technique : les données sont issues de sources multiples par exemple (la BDPM, base de données publique des médicaments) et localisées dans différents terminaux hétérogènes qu’il faut intégrer dans un système lui-même confronté à un format hétérogène ;
• l’évolution asynchrone : les connaissances comme les normes évoluent, ce qui implique une gestion régulière ;
• l’absence de passerelle entre les normes pharmaceutiques, or nous voulons penser ces données de manière large, notamment pour pouvoir les réutiliser”, a détaillé Mélissa Mary, qui œuvre avec Tayeb Merabti au sein du Centre de Gestion des Terminologies de Santé (CGTS) pour créer et intégrer des nouveaux standards de normes pharmaceutiques dans le SMT et élaborer  une norme nationale d’interopérabilité du médicament. Le catalogue des terminologies est déjà accessible en ligne, tandis que la nouvelle norme devrait voir le jour à la fin de l’année 2022.

Le serveur multi-terminologies

“Le CGTS est devenu un centre collaborateur de l’OMS en 2021. Nous y avons défini les processus d’intégration de toute terminologie santé car nous faisons face à de multiples terminologies issues de différentes unités de production, qui impliquent des formats et organisations différents”, a rappelé le chef de projet de l’ANS, Tayeb Merabti. Les principaux services du CGTS sont de déployer lesdites terminologies afin de promouvoir l’interopérabilité. “Pour le SMT, nous disposons désormais d’un méta-modèle multi-terminologique basé sur le langage sémantique Web -OWL [pour Web Ontology Language, un langage de représentation des connaissances, ndlr], ancien langage ‘supérieur’ utilisé pour décrire des ontologies et SKOS [pour Simple Knowledge Organization System, ndlr]. Ce réseau sémantique basé sur des correspondances entre terminologies permet d’intégrer et publier des référentiels terminologiques dans le SMT”, a poursuivi le chef de projet. Quatre étapes permettent de passer de la source au SMT :

• Analyser le modèle original,
• L’extraire et le transformer,
• Contrôler sa qualité puis l’exporter,
• Publier.

“Pour intégrer la BDPM dans le SMT, nous avons d’abord analyser les données pour en avoir une vision claire et comprendre les liens entre ses multiples tables pour en extraire les contenus. Ensuite nous avons extrait des modèles sémantiques et les avons traduit ou avons utilisé les standards sémantiques web utilisés dans le SMT. Enfin, nous avons contrôlé l’ontologie obtenue et l’avons exportée dans le SMT pour publication”, a illustré Tayeb Merabti. Le SMT compte onze terminologies disponibles en OWL et plus de 1 500 téléchargement depuis avril 2021. À partir de ces terminologies, il est possible de retrouver les principales terminologies de l’OMS, disponibles en français et en anglais grâce à l’outil de traduction automatique développé par l’équipe du chef de projet. Le SMT est régulièrement mis à jour, tenant notamment compte de la nomenclature européenne des dispositifs médicaux (EMDN), utilisée par les fabricants pour enregistrer leurs dispositifs médicaux dans la base de données EUDAMED (European database on medical device).

Depuis novembre 2020, l’équipe de Tayeb Merabti construit ce serveur doué d’un réseau sémantique dans l’idée de centraliser la diffusion de chaque terminologie via un point institutionnel. Nombre d’améliorations et de fonctionnalités ont été apportées depuis : le serveur dispose d’un catalogue de terminologies de métadonnées, de concepts, de sets d’API [interface de programmation d’application, ndlr] ainsi que de “smart data endpoints” récemment intégrés visant à créer des ontologies. Pour le chef de projet, “l’objectif des deux prochaines années est de disposer de cartographies des liens entre les terminologies publiées dans le SMT, comme cela a été fait récemment entre l’UCB et la BDPM, l’ICD-10 [International Classification of Diseases] et la CCAM [classification commune des actes médicaux, ndlr], les trois principales terminologies médicales et médicamenteuses récemment intégrées”, a-t-il conclu.